מטופלים רבים באשדוד ובסביבתה נזקקים מדי שנה לטיפולים כירורגיים. המערך הכירורגי בבית החולים אסותא אשדוד ע"ש סמסון מספק להם, לראשונה, שירותי ניתוח מתקדמים ומגוונים – שמבוצעים על ידי מנתחים מהשורה הראשונה, במסגרת ציבורית, בקרבת מקום מגוריהם.
המערך הכירורגי באסותא אשדוד ע"ש סמסון, מעניק שירות כולל ומקיף במגוון רחב של תחומים, משלב ההכנה, דרך הניתוח עצמו ועד להתאוששות והשיקום. במסגרת המערך מבוצעים הן ניתוחים אלקטיביים שנקבעים מראש והן ניתוחים דחופים. הניתוחים מבוצעים בחדרי ניתוח מתקדמים המצוידים בטכנולוגיות חדשניות, שמאפשרים לצוות המקצועי לבצע ניתוחים מורכבים.

במסגרת מערך הכירורגיה, פועלות גם מרפאות מתמחות, שבראש כל אחת מהן ניצב מומחה בעל ידע ספציפי, שנועדו לסייע באבחון, ייעוץ ומעקב אחר מגוון רחב של מצבים רפואיים ובהם מחלות המעי הגס והרקטום, מחלות ושט וקיבה כולל סרטן, מחלות כבד ולבלב, השמנת יתר קיצונית, מחלות שד, בקעים ועוד.

את המערך מנהל פרופ' אנדריי קידר ולצידו רופאים מומחים בשלל תחומי הכירורגיה, מתמחים הפועלים תחת הדרכת הרופאים המומחים, צוות סיעודי מנוסה וצוות רפואי מסייע. לדברי פרופ' קידר: "אנו שמים דגש על יחס מכבד לכל מטופל, על טיפול בגובה העיניים, על בטיחות, על השתלמות מתמדת בידע העדכני ביותר ועל שימוש בטכנולוגיות החדישות ביותר. מטרתנו היא לספק לכל מטופל את המענה הטוב והבטוח ביותר".