המכון לפתולוגיה משרת את כל מחלקות האשפוז והמערך האמבולטורי של בית החולים. הצוות הרפואי והמעבדתי של המכון לפתולוגיה עוסק במתן אבחון לכל דגימות הרקמה (ביופסיות) או נוזלי הגוף שנלקחים במרפאות, במחלקות האשפוז ולאחר ניתוח.

כל רקמה שהוצאה במהלך ניתוח על ידי כירורג בחדר הניתוח או במהלך אשפוז, מועברת למכון לפתולוגיה להכנת תכשירים היסטולוגים שמהווים בסיס לאבחנה.

במהלך הניתוח מתבצע חתך קפוא כדי לתת מענה על שאלות המתעוררות במהלך הניתוח.
בהתאם לאבחנה הפתולוגית, מחליט הרופא המטפל על תכנית טיפולית המשכית המתאימה למטופל.

במכון לפתולוגיה מעבדה להיסטולוגיה כללית, מעבדה להיסטוכימיה, מעבדה לאימונוהיסטוכימיה ומעבדה לציטולוגיה.

המכון לפתולוגיה היום פועל בשיתוף פעולה עם כל מחלקות בית החולים הציבורי אסותא אשדוד, בהנהלתה של דר' מקלקובסקי מרינה ועובדים בו פתולוגים מומחים במגוון רחב של תחומים. לצדם, עובדים במכון מתמחים תחת פיקוח הרופאים המומחים וכן צוות מעבדה.

המכון מקיים פגישות צוות אינטרדיסציפלינריות עם מחלקות המרכז הרפואי השונות, הכוללות הצגת פתולוגיה של מקרים נבחרים ודיון באספקטים קליניים, רדיולוגיים וטיפוליים.

"המטרה שלנו במכון לפתולוגיה היא לתת אבחון מדויק ומהיר ככול הניתן על מנת לעזור למטופל לקבל הטיפול הנדרש והטוב ביותר".

לדבריה של מנהלת המכון, ד"ר מקלקובסקי: "שמחתי להגיע לבית חולים אסותא אשדוד ולהמשיך את הקמת המכון. המכון לפתולוגיה הינו בעל חשיבות מרכזית לרוב מחלקות בית החולים. השאיפות העתידיות שלנו לפתח הכנסת טכנולוגיות חדשניות ומתקדמות, לקחת חלק פעיל במחקרים קליניים והכשרת מתמחים".